Využití XML pro sdílení elektrofyziologických dat  - CONFLUENCE08

Ukládání digitalizovaných elektrofyziologických dat (například EEG) není dáno jednotnou normou. Téměř každý výrobce zařízení pro digitální elektroencefalografii má vlastní formát. Možnosti konverze jsou velmi omezené.

Relativně rozšířený je Evropský datový formát (EDF). Jedná se o binární formát, relativně rigidní, při prohlížení v binárním editoru poměrně málo přehledný. Navíc má některá omezení.

 

Babylonská věž - symbol zmatení jazyků - jak si ji představoval v roce 1563 holandský malíř Pieter Brueghel starší.

Různé systémy digitálního EEG mají omezené možnosti předávání dat. Bude řešením Evropský datový formát? Nebo XML?

 

V počítačovém světe se stále silněji prosazuje jiný formát pro ukládání dat – XML (Extensible Markup Language), který je velmi univerzální (není zdaleka omezen jen na medicínu), podporovaný velkým množstvím software atd.

V praxi se často setkáváme, že studenti řádného studia a PhD potřebují data z biomedicínských měření pro výzkum, narážejí na problém, jak měrná data načíst do svých programů atd.

 Záměry:

Řešitelé:

za VŠB – TU Ostrava

 

za FN Ostrava

 

KE STAŽENÍ:

Budujeme databázi EEG a dalších elektrofyziologických dat ve 3 paralelních tvarech: originální data, data ve formátu EDF a stejná data ve formátu XML.

Originální data EDF XML

Prohlížečka originálních dat EEG Wave 

   
  • ABSENCE01
    Video-EEG pacienta s absencemi v originálním formátu
  • ABSENCE01
    Stejný záznam (bez videa) ve formátu EDF
  • ABSENCE01
    Stejný záznam (bez videa) ve formátu XML
  • JME01
    Video-EEG pacienta s juvenilní myoklonickou epilepsií
  • JME01
    Stejný záznam (bez videa) ve formátu EDF
  • JME01
    Stejný záznam (bez videa) ve formátu EDF

 

 

Odkazy:

  1. Evropský datový formát - specifikace

  2. Software pro EDF

  3. XML Editor XML Marker

  4. Specifikace XML

 

Hlavní stránka projektu CATON4MHC